Há uma lista com os "melhores tweaks" em vários sites, porém, percebe-se que essa lista é praticamente a mesma, a qual há aplicativos que já foram descontinuados há bastante tempo, aqui segue uma lista com os melhores tweaks, todos compatíveis com a última versão do firmware do iOS.
Action menu: Serve para adicionar algumas opções, dentre elas a de fazer o Celeste funcionar.
Activator: Trata-se de um tweak que permite a customização de gestos, cliques de botões e chaqualhadas do aparelho para ativar uma infindade de recursos que podem ser configurados.
AddCallHistory: Este tweak serve para adicionar chamadas no registro do iphone.
Airplane SBsttings: Adiciona o modo avião na SBsttings.
Appstore update size: Serve para ver o tamanho das atualizações na Appstore.
Attachmentsaver: Torna possível baixar arquivos diretamente do e-mail.
Auto3G: Desliga a conexão 3G enquanto o iphone está em repouso, deixando apenas a edge, e habilitando o 3G assim que o iphone estiver na tela inicial.
Barrel: Adiciona várias formas de transição das springboards, em cubo, carrossel, dentre outras.
Better White Icon Label: Volta as sombras nos nomes dos aplicativos após a instalação do WinterBoard.
BiteSMS: Ótimo aplicativo para enviar e responder sms sem sair do aplicativo que está utilizando.
BootLogo: Personaliza a tela de inicialização.
Celeste: Torna possível o envio e recebimento de arquivos através do Bluetooth.
ChatPic: Adiciona as fotos dos seus contatos nas mensagens.
ColorKeyboard: Personaliza o teclado do iDevice.
Covert: Adiciona o modo de navegação privada no safari.CyDelete: Serve para apagar aplicativos do Cydia da mesma forma como os demais, diretamente da springboard.
Cydia Translations: Tradução do Cydia para português.
Cyntact: Adiciona fotos ao contatos.
Fake operador: Permite a personalização do nome da operadora.
Fast Copy: Melhora a função do copiar e colar acabando com atraso.
FolderEnhancer: Permite colocar pastas dentro de pastas e também um maior número de aplicativos dentro das mesmas.
FullScreen for Safari: Adiciona a opção de navegação em tela cheia e ainda várias funções bem interessantes de navegação, tais como fechar página, mudar de página, acessar os favoritos dentre outras.
iBlacklist: O verdadeiro firewall do iphone, recebe ligações, sms e mms apenas de quem desejar.
iFile: Gerenciador de arquivos.
Installous: Ferramenta para instalar aplicativos da Appstore.
iProtect: Protege seus aplicativos com senha, permitindo escolher qual aplicativo deverá solicitar senha ao ser iniciado.
My3G: Permite que use seu iphone numa rede 3G como se estivesse em WiFi, pode-se fazer face time usando a rede 3G.
No Bookmarks: Impede o Safari de abrir a pasta de favoritos, sempre que você abrir o browser.
Notifier+: Melhora as notificações do idevice.
Photoalbums+: Permite a criação de pastas para fotos diretamente no iphone.
QuickScroll 2: Adiciona uma excelente barra de rolagem no dispositivo.
Recent/CallLog Delete: Adiciona a função de apagar individualmente uma chamada.
Safari Download Manage: Adiciona a função de baixar arquivos diretamente do Safari.
SBRotator: Permite colocar a springboard em modo paisagem.
SBSettings: Gerencie vários ajustes com um simples movimento.
SleepFX: Personaliza a forma como se adormece e acorda seu igadget.
SpringFlash: Adiciona a função lanterna ao iphone 4.
StayOpened: Instala aplicativos na Appstore sem sair da loja. É muito semelhante à versão mais recente do Cydia.
Switcher Rotator: Deixa a barra de multitarefa no modo paisagem quando a springboard também estiver no mesmo modo.
Vmoji 4: Adiciona emoticons no teclado nativo do idevice.
WeatherIcon: Permite que a temperatura real apareça na springboard.
Winterboard: Gerenciador de temas para o iDevice.
Yourtube 2: adiciona a função de fazer download dos vídeos, dentro do aplicativo Youtube oficial da Apple.
Espero que essa lista seja bastante útil, atualmente tenho todos esses tweaks instalados no meu iphone.
Abraços.